Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms