Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMPQ9H6B4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms