Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX5Q9H2C1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms