Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms