Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM5Q9C035 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms