Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms