Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM6SF1Q9BZW5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms