Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC11CQ9BY50 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC11CQ9BY50 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms