Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms