Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms