Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYCP2Q9BX26 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
SYCP2Q9BX26 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYCP2Q9BX26 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms