Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms