Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD3Q9BV44 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
THUMPD3Q9BV44 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THUMPD3Q9BV44 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THUMPD3Q9BV44 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms