Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf16Q9BUW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms