Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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