Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms