Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HINFPQ9BQA5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINFPQ9BQA5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms