Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX50Q9BQ39 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms