Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSG101Q99816 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSG101Q99816 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSG101Q99816 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms