Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPAS2Q99743 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPAS2Q99743 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms