Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN2Q99700 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN2Q99700 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms