Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3CQ99613 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms