Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIK3R4Q99570 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3R4Q99570 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PIK3R4Q99570 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms