Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PHOX2BQ99453 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms