Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UHRF1Q96T88 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms