Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R9BQ96SB3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R9BQ96SB3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms