Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HHIPQ96QV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms