Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD27Q96NW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms