Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms