Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms