Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIGD1Q96MW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms