Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms