Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms