Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK3Q96L96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms