Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms