Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP47Q96K76 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP47Q96K76 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms