Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms