Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A4AQ96JQ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms