Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms