Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEIL1Q96FI4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms