Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4CQ96DT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms