Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RCN3Q96D15 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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