Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1MTQ969P6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms