Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRUQ92729 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms