Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms