Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms