Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3IP1Q8TDR0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms