Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-3Q8TAU0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-3Q8TAU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms