Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms