Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APCDD1LQ8NCL9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms